PoczątkiZakładu Ochrony Przyrody Obszarów Wiejskichsięgają roku 1953, kiedy to w nowo powołanymInstytucie Melioracji i Użytków ZielonychpowstałDział Kształtowania Środowiska Przyrodniczego, przekształcony w kolejnym roku działania Instytutu w samodzielnyZakład Kształtowania Środowiska Przyrodniczego. W roku 1957 znienił nazwę naZakład Przyrodniczych Podstaw Melioracji, do którego włączono w roku 1969Zakład Wykorzystania Torfowisk. W roku 1992 Zakład Przyrodniczych Podstaw Melioracji przekształcony został wZakład Ekorozwoju Przestrzeni Rolniczej, by ostatecznie 1998 roku przyjąć dzisiejszą nazwę.

Od początku istnienia Zakładu prowadzono studia związane zproblemami przekształcania środowiska przyrodniczego siedlisk hydrogenicznych. Wynikiem tego jest zgromadzona przez 50 lat wiedza oraz dane parametryczne o mokradłach Polski, unikalny w skali kraju zbiór materiałów zachowujących pełną merytoryczną ciągłość z pracami wybitnych torfoznawców przedwojennych.

W zakładzie stworzonopolską szkołę gleb hydrogenicznychi współtworzono podwalinypolskiego łąkarstwa.