• ochrona i wzbogacanie różnorodności biologicznej i krajobrazowej obszarów rolniczych, w tym zwłaszcza położonych w dolinach rzecznych;

• biologiczna i krajobrazowa renaturalizacja obszarów rolniczych i po-rolniczych;

• waloryzacja przyrodnicza obszarów rolniczych w różnych uwarunkowaniach geograficznych;

• zasady integrowania ochrony walorów przyrodniczych z działalnością rolniczą.

• wypracowanie podstaw kształtowania walorów przyrodniczych obszarów wiejskich według zasad zrównoważonego rozwoju oraz przepisów i wymogów obowiązujących w Unii Europejskiej;

• opracowanie wymogów niezbędnych do zachowania wartości przyrodniczych obszarów rolniczych z uwzględnieniem różnych form ich ochrony;

• rozwijanie metodyki waloryzacji przyrodniczej terenów wiejskich;

• badanie ekologicznych i fizjograficznych uwarunkowań gospodarki wodnej na obszarach rolniczych;

• rozwijanie metod i technik badawczych umożliwiających wielkoskalowe rozpoznanie terenu jako podstawy racjonalnego planowania przestrzennego;

• badania zmian gleb organicznych i bioróżnorodności łąk uprawnych w warunkach minimalizowania odwodnień.

• opracowywanie ekspertyz w zakresie renaturalizacji różnego typu użytków rolnych;

• lokalizowanie wartościowych biotopów w krajobrazie rolniczym, predestynowanych do różnych form ochrony, jako elementów składowych krajobrazu rolniczego;

• rozwijanie, uaktualnianie i udostępnianie baz danych o siedliskach hydrogenicznych w skali kraju;

• ocena zmian warunków wodnych i glebowych w zmeliorowanych niegdyś siedliskach hydrogenicznych obszarów chronionych;

• obserwowanie i sygnalizowanie zmian zagrażających stabilności walorów przyrodniczych na terenach wiejskich;

• określanie warunków glebowo-wodnych siedlisk hydrogenicznych, zapewniających ochronę ich walorów.

Zakład współpracuje ściśle z Zakładem Doświadczalnym MUZ w Biebrzy.