Doc. dr hab. inż. Magdalena Borys ukończyła Wydział Melioracji Wodnych SGGW-AR w Warszawie, uzyskując w roku 1976 stopień magistra inżyniera po obronie pracy magisterskiej pt. "Próba klasyfikacji gruntów organicznych pod względem ich nośności".

W tym samym roku rozpoczęła pracę w Zakładzie Budownictwa Wodno-Melioracyjnego IMUZ w Falentach , w Pracowni Geotechniki, zaczynając od stanowiska Asystenta, później Starszego Asystenta. W roku 1983 obroniła przed Radą Naukową IMUZ rozprawę doktorską pt. "Zmiany wytrzymałości niezamulonego torfu niskiego pod wpływem odwodnienia i obciążenia złoża torfowego", uzyskując stopień doktora nauk technicznych i stanowisko Adiunkta. Na podstawie rozprawy habilitacyjnej pt. "Niskie nasypy z miejscowych gruntów organicznych dla potrzeb budownictwa wodno-melioracyjnego" oraz pozytywnie zdanego kolokwium w 1994 roku Rada Naukowa IMUZ nadała jej stopień naukowy doktora habilitowanego nauk rolniczych w zakresie kształtowania środowiska. W tym samym roku została mianowana na stanowisko docenta. Od roku 1992 kieruje w IMUZ Zakładem Inżynierii Wodno-Melioracyjnej.

Na jej dotychczasowy dorobek składa się 120 publikacji wydanych drukiem. Brała także udział w opracowaniu 160 prac nie opublikowanych oraz opinii, ekspertyz i prac projektowych wykonanych na zlecenie podmiotów gospodarczych, 1 normy i 18 aprobat technicznych.

Była promotorem 1 przewodu doktorskiego i 4 prac inżynierskich, obecnie jest promotorem 1 pracy doktorskiej. Ponadto byłam recenzentem 4 prac doktorskich i 1 rozprawy habilitacyjnej oraz kilkunastu publikacji naukowych skierowanych do druku w takich czasopismach jak: Woda-Środowisko-Obszary Wiejskie, Annals of Warsaw Agricultural University, Przegląd Naukowy Inżynieria i Kształtowanie Środowiska, Wiadomości Melioracyjne i Łąkarskie.

Brała udział w realizacji szeregu projektów badawczych, w tym jako kierownik 1 projektu zagranicznego (P9312-06-02 308/93 pt. "Studium Identyfikacji Potrzeb Budowy Urządzeń Sanitarnych i Wodnych", w ramach projektu PHARE P9312/06 "Infrastruktura Terenów Wiejskich dla Gospodarki Wodnej" - realizowanego w latach 1995-1996) oraz finansowanych przez KBN 1 projektu zamawianego, 2 projektów własnych, 1 projektu promotorskiego i jako główny wykonawca 1 projektu własnego.

Ukończyła międzynarodowy kurs z zakresu odwodnień (International Course on Land Drainage) w Wageningen (Holandia) w 1980 r. oraz kurs "Zasady ocen oddziaływania na środowisko" zorganizowany w Warszawie przez US EPA w 1998 r.

Pełni szereg funkcji organizacyjnych, zarówno w IMUZ jak i poza nim, w różnych instytucjach i organizacjach naukowych, w tym: Polskiego Komitetu Międzynarodowego Stowarzyszenia Torfowego (IPS), gdzie w latach 1992-1993 pełniła funkcję sekretarza, Stowarzyszenia Inżynierów i Techników Wodnych i Melioracyjnych Naczelnej Organizacji Technicznej (SITWM NOT), Polskiego Komitetu Geotechniki (PKG), gdzie od roku 2005 pełni funkcję zastępcy przewodniczącego Oddziału Stołecznego, Międzynarodowego Komitetu Geotechniki (ISSMGE), Międzynarodowej Komisji Nawodnień i Odwodnień (ICID), Polskiego Komitetu Narodowego Międzynarodowego Systemu Redukcji Zagrożeń (ISDR), jako przedstawiciel Ministerstwa Rolnictwa i Rozwoju Wsi. W latach 2004-2005 uczestniczyła w pracach w trakcie trwania XXVIII konkursu projektów badawczych Sekcji Nauk o Kształtowaniu Środowiska i Gospodarki Wodnej (P06S) Zespołu Nauk Rolniczych i Leśnych Komitetu Badań Naukowych. Jest członkiem Rady Naukowej IMUZ, w tym była sekretarzem w trzech kolejnych kadencjach tj. w latach 1995-1999, 1999-2003 i 2003-2007, członkiem Rady Programowej i Komitetu Redakcyjnego Wydawnictw IMUZ.

Jest również rzeczoznawcą SITWM NOT, biegłym Ministra Ochrony Środowiska Zasobów Naturalnych i Leśnictwa i biegłym z listy Wojewody Mazowieckiego w zakresie sporządzania ocen oddziaływania na środowisko.

Ponadto od 2002 roku zatrudniona jest w Wyższej Szkole Przedsiębiorczości i Rozwoju Regionalnego na stanowisku profesora. Sprawuje tam funkcję dziekana Wydziału Ochrony Środowiska.

Za działalność naukową została wyróżniona Nagrodą Zespołową I stopnia Ministra Rolnictwa i Gospodarki Żywnościowej (1980) i Nagrodą Zespołową Ministra Edukacji Narodowej i Sportu (2003). Jest odznaczona Złotym Krzyżem Zasługi (2003) i Srebrną Odznaką Honorową SITWM NOT (2002).